师资队伍
教授
张永杰
编辑:必赢亚州,必赢贵宾会 发布时间:2019-12-30 来源:生命科学学院

张永杰,男,1979年生,博士,教授,博士生导师,山西省“三晋英才”支持计划入选者。毕业于中国科学院研究生院(现中国科学院大学),曾先后留学加拿大麦克马斯特大学和美国加州大学伯克利分校。担任中国菌物学会理事,《菌物学报》、《菌物研究》、《食用菌学报》等期刊编委,生命科学学院生物工程系主任和教工第二党支部书记。

一、教学与指导学生情况:

目前,承担本科生的《微生物学》、《新生研讨课》、《毕业论文指导》等课程和研究生的《现代微生物分类学》、《微生物代谢产物的开发与利用》、《现代生物技术及应用》、《生命科学前沿》等课程的教学工作。还曾承担过本科生的《生物制药基础及应用》和研究生的《微生物资源与生态学》课程。

指导完成本科生科研训练项目3期共9人次和本科生毕业论文设计共21人次。

2009年起受聘硕士生导师,2019年起受聘博士生导师,累计指导研究生共21人,已毕业15人。培养的研究生中多人次获国家奖学金、校优秀研究生、校优秀毕业研究生、校优秀学位论文、学业奖学金等荣誉。

本研究团队可招收研究生的专业:微生物学、细胞生物学、食品科学、农业推广(含资源利用与植物保护、食品加工与安全2个专业)、食品工程。我们长期招收研究生,欢迎报考!

二、研究兴趣:

进化生物学(Evolutionary Biology)是研究生物进化过程和生物多样性的学科,近二十年来经历了一个快速发展和变革的时期,已成为生命科学领域发展最为迅速的分支学科之一。随着微生物生理学和基因组学的快速发展,以及微生物本身具有繁殖周期短的特性,微生物成为研究生物进化的理想材料。本课题组主要利用现代组学技术(基因组学、转录组学、比较基因组学、群体基因组学、宏基因组学等)开展微生物进化生物学的研究。主要研究内容有:1)真菌群体遗传与进化:利用多基因序列分析技术和组学手段研究重要真菌的群体遗传学,探究其物种分化水平、群体遗传结构、演化历程、谱系地理学等;2)真菌线粒体基因组学:组装重要真菌的线粒体基因组,通过种内和种间水平的比较寻找真菌线粒体DNA的进化规律,筛选重要真菌的线粒体遗传标记;3)真菌与宿主及环境的互作关系:从分子水平探究典型真菌与宿主及环境间的互作关系;4)食品微生物组:利用DNA高通量测序、质谱技术等研究发酵类食品及相关材料中的微生物群落结构及功能,鉴别功能微生物种类。本课题组瞄准微生物进化与利用的核心科学问题,将澄清一些重要微生物的进化历程,丰富和发展微生物进化理论体系,为珍稀真菌资源的保护及有益微生物的合理利用提供理论依据。

三、科研成果:

截至目前,本课题组已在国内外学术期刊上累计发表论文70余篇,其中在Mol Ecol、Environ Microbiol等国际刊物发表SCI论文37篇(总影响因子约110;单篇影响因子大于5的有4篇;累积引用愈千次);1篇论文曾入选“中国精品科技期刊顶尖学术论文”(F5000)。主编和参编学术专著各1部,获省、市级科学技术奖各1项,授权专利2项。

代表性文章:(#共同第一作者, *通讯作者)

1. Zhang Y.J., Zhang S., Li Y.L., Ma S.L., Wang C.S., Xiang M.C., Liu X., An Z.Q., Xu J.P.*, Liu X.Z.* Phylogeography and evolution of a fungal-insect association on the Tibetan Plateau. Molecular Ecology, 2014, 23(21): 5337-5355. (IF="6.494; SCI 2区)

2. Fan W.W., Zhang S.*, Zhang Y.J*. The complete mitochondrial genome of the Chan-hua fungus  Isaria cicadae : a tale of intron evolution in Cordycipitaceae. Environmental Microbiology, 2019, 21(2):864-879 (IF="5.395;SCI 2区)

3. Wang L., Zhang S., Li J.H.*, Zhang Y.J.*. Mitochondrial genome, comparative analysis and evolutionary insights into the entomopathogenic fungus  Hirsutella thompsonii . Environmental Microbiology, 2018, 20(9): 3393-3405 (IF="5.395;" SCI 2区)

4. Zhang S., Hao A.J., Zhao Y.X., Zhang X.Y., Zhang Y.J.* Comparative mitochondrial genomics toward exploring molecular markers in the medicinal fungus  Cordyceps militaris . Scientific Reports, 2017, 7: 40219 (IF="5.228;" SCI 2区).

5. Zhang S., Zhang Y.J.*. Proposal of a new nomenclature for introns in protein-coding genes in fungal mitogenomes. IMA Fungus, 2019, 10:15 (IF="4.5;SCI 2区)

6. Zhang Y.J., Zhang S., Wang M., Bai F.Y., Liu X.Z.* High diversity of the fungal community structure in naturally-occurring  Ophiocordyceps sinensis. PLoS ONE, 2010, 5(12): e15570. (IF="4.411;SCI 4区)

7. Zhang Y.J.#, Xu L.L.#, Zhang S., Liu X.Z.*, An Z.Q., Wang M., Guo Y.L. Genetic diversity of  Ophiocordyceps sinensis , a medicinal fungus endemic to the Tibetan Plateau: Implications for its evolution and conservation. BMC Evolutionary Biology, 2009, 9: 290. (IF=4.294;SCI 4区)

8. Nie Y.#, Wang L.#, Cai Y., Tao W., Zhang Y.J.*, Huang B*. Mitochondrial genome of the entomophthoroid fungus Conidiobolus heterosporus provides insights into evolution of basal fungi. Applied Microbiology and Biotechnology, 2019, 103(9):1379–1391 (IF="3.34;" SCI 2区)

9. Zhang S.*, Zhang Y.J.*, Li Z.L. Complete mitogenome of the entomopathogenic fungus  Sporothrix insectorum RCEF 264 and comparative mitogenomics in Ophiostomatales. Applied Microbiology and Biotechnology, 2019, 103(14):5797-5809 (IF="3.34; SCI 2区)

10. Sandor S., Zhang Y.J., Xu J.P*. Fungal mitochondrial genomes and genetic polymorphisms. Applied Microbiology and Biotechnology, 2018, 102: 9433-9448. (IF="3.34;" SCI 2区)

11. Zhang Y.J.*, Yang X.Q., Zhang S., Humber R.A., Xu J.P.* Genomic analyses reveal low mitochondrial and high nuclear diversity in the cyclosporin-producing fungus  Tolypocladium inflatum . Applied Microbiology and Biotechnology, 2017, 101(23): 8517-8531. (IF="3.34; SCI 2区)

12. Zhang Y.J.*, Zhang H.Y., Liu X.Z., Zhang S*. Mitochondrial genome of the nematode endoparasitic fungus  Hirsutella vermicola reveals a high level of synteny in the family Ophiocordycipitaceae. Applied Microbiology and Biotechnology, 2017, 101(8): 3295-3304(IF="3.34; SCI 2区).

13. Zhang S., Wang X.N., Zhang X.L., Liu X.Z., Zhang Y.J.* Complete mitochondrial genome of the endophytic fungus Pestalotiopsis fici : features and evolution. Applied Microbiology and Biotechnology, 2017, 101(4): 1593–1604 (IF="3.34;" SCI 2区).

14. Zhang Y.J.*, Hou J.X., Zhang S., Hausner G., Liu X.Z.*, Li W.J. The intronic minisatellite OsMin1 within a serine protease gene in the Chinese caterpillar fungus  Ophiocordyceps sinensis . Applied Microbiology and Biotechnology, 2016, 100(8): 3599-3610 (IF="3.34;" SCI 2区)

15. Zhang Y.J.#, Skaar I.#, Sulyok M., Liu X.Z., Rao M.Y., Taylor J.W*. The microbiome and metabolites in fermented Pu-erh tea as revealed by high-throughput sequencing and quantitative multiplex metabolite analysis. PLoS One, 2016, 11(6): e0157847. (IF="3.057;" SCI 3区)

16. Wang N.N.#, Zhang Y.J. #, Jiang X.Z., Shu C., Hamid M.I., Hussain M., Chen, S.Y., Xu J.P., Xiang M.C., Liu X.Z. Population genetics analyses of  Hirsutella rhossiliensis , a dominant parasite of cyst nematode juveniles at a continental scale. Applied and Environmental Microbiology, 2016, 82(21): 6317-6325. (IF="3.823;" SCI 3区)

17. Zhang Y.J.*, Zhang S., Zhang G.Z., Liu X.Z., Wang C.S., Xu J.P.* Comparison of mitochondrial genomes provides insights into intron dynamics and evolution in the caterpillar fungus  Cordyceps militaris . Fungal Genetics and Biology, 2015, 77: 95-107. (IF="2.933;SCI 3区)

18. Zhang S.#, Zhang Y.J.#, Liu X.Z.*, Zhang H., Liu D.S. On the reliability of DNA sequences of  Ophiocordyceps sinensis in public databases. Journal of Industrial Microbiology and Biotechnology, 2013, 40: 365-378 (IF="2.505;" SCI 2区).

19. Sun X.Y.#, Kang S. #, Zhang Y.J. #, Tan X.Q., Yu Y.F., He H.Y., Zhang X.Y., Liu Y.F., Wang S., Sun W.X., Cai L., Li S.J.* Genetic diversity and population structure of rice pathogen  Ustilaginoidea virens  in China. PLOS ONE, 2013, 8(9): e76879 (IF="3.534;" SCI 2区)

20. Zhang Y.J., Bai F.R., Zhang S., Liu X.Z*. Determining novel molecular markers in the Chinese caterpillar fungus  Ophiocordyceps sinensis by screening a shotgun genomic library. Applied Microbiology and Biotechnology, 2012, 95: 1243-1251 (IF="3.689; SCI 2区)

21. Zhang S.#, Zhang Y.J.#, Liu, X.Z.*, Wen H.A., Wang M., Liu D.S. Cloning and analysis of the  MAT1-2-1  gene from the traditional Chinese medicinal fungus  Ophiocordyceps sinensis . Fungal Biology, 2011, 115(8): 708-714. (IF="2.809;" SCI 3区)

22. Zhang Y.J., Liu X.Z.*, Wang M. Cloning, expression and characterization of two novel cuticle-degrading serine proteases from the entomopathogenic fungus,  Cordyceps sinensis  . Research in Microbiology, 2008, 159(6): 462-469. (IF="2.055;" SCI 3区)

更多文章详见:https://www.researchgate.net/profile/Yong_Jie_Zhang/research

著作:

1. Zhang Y.J., Xu J.P. Molecular Mechanisms of Fungal Adaptive Evolution, In: P.H. Rampelotto (Ed.), Molecular Mechanisms of Microbial Evolution, Springer, Cham, Switzerland, 2018, pp. 409-435

2. 张永杰. 冬虫夏草菌的生物学研究. 北京:科学出版社,2012

四、科研项目:

先后承担科研项目19项,其中省部级以上16项。代表性科研项目如下:

1. 国家自然科学基金:蛹虫草线粒体DNA的遗传多样性与线粒体遗传机制的研究(31872162),2019

2. 国家自然科学基金:通过多基因序列分析研究冬虫夏草菌与寄主昆虫的协同进化(31140013),2012

3. 国家自然科学基金:冬虫夏草的真菌群落结构及对真菌资源开发潜力的评价(81102759),2012

4. 教育部高等学校博士学科点专项科研基金:名贵药材冬虫夏草真菌群落研究(20101401120007),2011

5. 山西省回国留学人员科研资助项目:基于线粒体基因组的虫草类真菌的系统进化研究(2017-015),2017

6. 山西省自然科学基金:山西省虫草资源调查及其虫草菌的研究 (201601D011065),2016

7. 山西省留学回国人员科技活动择优资助项目:参与普洱茶后发酵生产的关键微生物物种的鉴别,2016

8. 山西省自然科学基金:分离自冬虫夏草可培养真菌资源的前期开发研究(2014021030-2),2014

9. 真菌学国家重点实验室开放课题:冬虫夏草菌的线粒体基因组测序及比较线粒体基因组学研究,2013  

联系方式:

E-mail: zhangyj2008@sxu.edu.cn

电话:壹叁伍肆陆叁捌零叁伍贰

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